故事背景设定在 2039 年。二十五年来，核战争后的最后幸存者们一直被困在莫斯科废墟下幽暗的地铁隧道中，陷入了残酷的冲突。 如今，地下的各方势力已被统一在“新帝国”（Novoreich）的旗帜下，由新任元首——传奇的斯巴达战士“亨特”（Hunter）领导。 元首承诺将带领民众回到地表开启新生活，但现实中，社区依然被囚禁在地铁深处，充斥着政治宣传与虚假信息，在独裁统治下受苦。
玩家将扮演“陌生人”（The Stranger），一个被暴力白日梦困扰的隐士。他被迫踏上了一段凶险的旅程，回到了那个他曾发誓永远不再踏入的地方——地铁。 “陌生人”将是一位拥有完整配音的主角，这标志着《地铁》在标志性的沉浸式故事叙述方面迈出了重要一步。